کریم باقری اصلا اهل جنجال نیست و ترجیح می دهد روی متن تمرکز کند، اما با این وجود مصاحبه هایش گاهی بسیار جنجالی می شود و اتفاقاً وقتی صحبت می کند از آن دسته افرادی است که نمی خواهد بپذیرد. سخنان او را رد کرده و اظهارات او را تکذیب کنید.
بازیکن سرشناس تیم ملی سال های نه چندان دور که تا چند ماه پیش مربی پرسپولیس هم بود در هفدهم. آبان او در ماه 1388 مصاحبه بسیار جالبی با خبروزشی انجام داد و به نکات جالبی اشاره کرد که حتی پس از 13 سال هنوز خواندن آن خالی از لطف نیست. آقا کریم در بخشی از این گفت و گو برای اولین بار به حضور خود در جمع بازیکنان پرسپولیس اشاره کرد و گفت: در اواسط دهه 70 که برای اولین بار به پرسپولیس آمدم، خیلی ها در تمرینات این تیم به من نگاه می کردند. من…» قرارداد 22 میلیون دلاری با این تیم و سر و صدای زیادی به پا کرد.
او همچنین مدعی شد که با علی دایی مشکلی ندارد و بحث مربیگری و دوستی کاملا جداست. باقری آبان او در سال 1388 معتقد بود که اگر به دایی فرصت کافی داده شود، می تواند پرسپولیس را قهرمان لیگ برتر کند. البته پرسپولیس آن فصل قهرمان لیگ نشد اما جام حذفی را برد.
کریم باقری همچنین به تاریخچه بازی ایران و استرالیا در ملبورن اشاره کرد و ادامه داد: با توجه به اتفاقاتی که رخ داده تمایلی به حضور در این دیدار نداشتم حتی اصرار داریوش مصطفوی هم نتوانست نظرم را تغییر دهد اما مدیرعامل در . در آن زمان باشگاه بیله فلد ارمنستان که من در آن زمان بازیکن این تیم بودم، اصرار داشت که باید در این بازی حضور داشته باشم و به همین دلیل این ملی پوش اروپایی به استرالیا آمد و اتفاقا اولین گل ما را در این بازی زد.