به گزارش مگتو همایون شجریان سی و یکم اردیبهشت ماه وی در سال 1354 در تهران و در خانواده ای اهل موسیقی به دنیا آمد. همایون شجریان فرزند محمدرضا شجریان و برادر کوچکتر مژگان شجریان است. همایون شجریان در سال ۱۳۷۵ با گیتا خوانساری ازدواج کرد و از این ازدواج فرزندی به نام یاسمین به دنیا آمد. شجریان در مصاحبه ای با عادل فردوسی پور در سال 1402 رابطه عاشقانه خود را با سحر دولتشاهی تایید کرد.