یک میکروسکوپ STEM (میکروسکوپ الکترونی انتقالی اسکن) می تواند بزرگنمایی حدود 10000000 و مقیاس 50 میکرومتر با پس زمینه تیره داشته باشد. در حالی که میکروسکوپ های نوری به مقیاس 200 نانومتر و بزرگنمایی کمتر از 2000 محدود می شوند.
میکروسکوپهایی که از پرتو الکترونهای شتابدار به عنوان منبع تابش استفاده میکنند، به عنوان میکروسکوپهای الکترونی شناخته میشوند. استفاده از میکروسکوپ الکترونی (Electron Microscope) یک تکنیک است که برای بدست آوردن تصاویر با وضوح بالا از نمونههای بیولوژیکی و غیربیولوژیکی استفاده میشود.